Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL3Q13618 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms