Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NAE1Q13564 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NAE1Q13564 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAE1Q13564 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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