Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SEMA3FQ13275 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3FQ13275 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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SEMA3FQ13275 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SEMA3FQ13275 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SEMA3FQ13275 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3FQ13275 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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