Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX3Q13185 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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