Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRDNQ13061 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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