Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK2Q13002 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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