Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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