Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRJQ12913 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRJQ12913 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPRJQ12913 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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