Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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KCNMA1Q12791 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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