Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms