Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms