Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GABPAQ06546 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms