Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCDQ05655 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms