Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP7AQ04656 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP7AQ04656 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms