Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
TOP2BQ02880 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP2BQ02880 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms