Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNTN2Q02246 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms