Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms