Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F1Q01094 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms