Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMO4P61968 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO4P61968 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO4P61968 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO4P61968 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO4P61968 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms