Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms