Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP25P60880 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP25P60880 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP25P60880 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP25P60880 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP25P60880 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms