Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms