Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BACE1P56817 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms