Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP6P55212 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP6P55212 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms