Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMP3P54852 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMP3P54852 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMP3P54852 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EMP3P54852 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms