Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRE11P49959 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRE11P49959 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms