Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNI2P48788 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms