Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTDSS1P48651 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms