Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTRNP46939 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTRNP46939 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTRNP46939 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UTRNP46939 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms