Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RANGAP1P46060 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RANGAP1P46060 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms