Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5CP41229 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5CP41229 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms