Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms