Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPC1P35052 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPC1P35052 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPC1P35052 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms