Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYKP34925 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RYKP34925 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RYKP34925 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYKP34925 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYKP34925 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms