Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCC1P33527 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms