Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms