Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms