Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTAFRP25105 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms