Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HOXA5P20719 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXA5P20719 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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