Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHCEP18577 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHCEP18577 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms