Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB4P17483 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms