Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB3P14651 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms