Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VIL1P09327 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms