Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1RP07333 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms