Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFDP00746 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFDP00746 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CFDP00746 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFDP00746 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CFDP00746 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFDP00746 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFDP00746 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFDP00746 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFDP00746 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CFDP00746 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms