Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBX7O95931 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CBX7O95931 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms