Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN9O95484 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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