Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRATO95237 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRATO95237 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRATO95237 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRATO95237 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms