Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFL1O94874 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFL1O94874 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFL1O94874 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms