Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MMAB-209ENST00000544051 1089 ntTSL 319.57■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NFATC1-214ENST00000590861 566 ntTSL 319.48■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RCSD1-204ENST00000472038 1719 ntTSL 219.47■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ADCY7-214ENST00000569265 497 ntTSL 219.36■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 219.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTPN23-204ENST00000477276 882 ntTSL 519.15■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BORCS8-MEF2B-207ENST00000602804 1804 ntTSL 219.1■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ADCY7-209ENST00000566761 670 ntTSL 519.09■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KRI1-208ENST00000537964 565 ntTSL 419.06■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KRI1-210ENST00000543682 571 ntTSL 319■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-209ENST00000486707 503 ntTSL 319■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMX4-203ENST00000527925 787 ntTSL 518.82■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KRI1-213ENST00000546063 740 ntTSL 418.73■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AP1AR-203ENST00000502954 547 ntTSL 318.73■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL16-203ENST00000531802 557 ntTSL 218.65■□□□□ 0.582e-13■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HDGFL3-203ENST00000563404 448 ntTSL 518.56■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AL137003.1-202ENST00000450930 635 ntTSL 218.53■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM32A-203ENST00000587351 401 ntTSL 518.5■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM50B-205ENST00000459909 618 ntTSL 218.43■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 WDPCP-210ENST00000431065 782 ntTSL 418.28■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCND3-222ENST00000612455 536 nt18.23■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SLC43A1-208ENST00000533263 690 ntTSL 518.16■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCM2-205ENST00000472223 981 ntTSL 318.11■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 VAMP4-204ENST00000482519 586 ntTSL 318.11■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PCYT2-217ENST00000574343 693 ntTSL 218.11■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-213ENST00000640437 1620 ntTSL 518.05■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTPN23-202ENST00000456221 592 ntTSL 417.98■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SLC37A1-206ENST00000471277 617 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM55B-203ENST00000553460 811 ntTSL 517.91■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CREB5-207ENST00000426500 753 ntTSL 317.87■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NFATC1-213ENST00000590313 1919 ntTSL 217.86■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BEST1-203ENST00000524877 5772 ntTSL 217.85■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BORCS8-MEF2B-208ENST00000630940 1664 ntTSL 217.84■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SAP30BP-219ENST00000583170 553 ntTSL 417.83■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 217.83■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-13■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 517.58■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DDX41-201ENST00000330503 2137 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 B9D2-202ENST00000594416 848 ntTSL 317.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 517.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 INPPL1-212ENST00000541752 856 ntTSL 217.38■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TAGLN-205ENST00000529792 375 ntTSL 317.37■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SAP30BP-205ENST00000578288 870 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DDX41-207ENST00000507900 1564 ntTSL 517.27■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-204ENST00000462783 693 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LDHB-210ENST00000544151 544 ntTSL 217.17■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 217.16■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-209ENST00000441192 1224 ntTSL 517.16■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 SEPT5-205ENST00000412544 1108 ntTSL 517.14■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 133.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1371 ms